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當(dāng)心!出現(xiàn)這些現(xiàn)象,你的實(shí)驗(yàn)可能存在核酸污染!

更新時(shí)間:2024-10-16  |  點(diǎn)擊率:295

聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)實(shí)驗(yàn)是分子生物學(xué)領(lǐng)域中的一項(xiàng)核心技術(shù),用于擴(kuò)增特定的DNARNA片段。然而,由于其高度敏感性,PCR實(shí)驗(yàn)極易受到各種形式的污染,特別是核酸污染。核酸污染不僅會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性,還可能誤導(dǎo)后續(xù)的研究和分析。因此,在進(jìn)行PCR實(shí)驗(yàn)時(shí),必須高度警惕可能出現(xiàn)的核酸污染跡象,并采取相應(yīng)的應(yīng)對措施。

一、需警惕的核酸污染跡象

  1. 非特異性擴(kuò)增
         
    非特異性擴(kuò)增是PCR實(shí)驗(yàn)中常見的污染跡象之一。當(dāng)實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)與預(yù)期目標(biāo)片段不符的擴(kuò)增產(chǎn)物時(shí),可能是由于環(huán)境中存在的其他核酸片段被錯(cuò)誤地?cái)U(kuò)增。這種非特異性擴(kuò)增往往會(huì)導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的復(fù)雜性和不確定性增加。

  2. 假陽性結(jié)果
         
    假陽性結(jié)果是另一個(gè)需要警惕的污染跡象。即使樣本本身不含有目標(biāo)核酸,如果實(shí)驗(yàn)環(huán)境中存在微量的核酸污染,也可能導(dǎo)致擴(kuò)增反應(yīng)的發(fā)生,從而產(chǎn)生假陽性結(jié)果。這種結(jié)果不僅浪費(fèi)實(shí)驗(yàn)資源,還可能對后續(xù)的研究產(chǎn)生誤導(dǎo)。

  3. 實(shí)驗(yàn)重復(fù)性差
         
    如果PCR實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性較差,即相同條件下多次實(shí)驗(yàn)的結(jié)果不一致,那么很可能是受到了核酸污染的影響。污染物的存在會(huì)干擾擴(kuò)增反應(yīng)的正常進(jìn)行,導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性降低。

  4. 擴(kuò)增效率低下
         
    當(dāng)實(shí)驗(yàn)中的擴(kuò)增效率低下時(shí),也需要警惕是否存在核酸污染。污染物的存在可能會(huì)與目標(biāo)核酸競爭反應(yīng)資源,如引物、酶和底物等,從而降低擴(kuò)增效率。

二、可能的核酸污染來源

  1. 樣本污染
         
    樣本在采集、處理或儲(chǔ)存過程中可能受到污染。例如,收集樣本的容器被污染,或樣本密封不嚴(yán)導(dǎo)致外溢等。

  2. 試劑污染
         
    試劑在制備、儲(chǔ)存和使用過程中也可能受到污染。如果試劑被污染,那么整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程都可能受到影響。

  3. 氣溶膠污染
         
    氣溶膠是PCR實(shí)驗(yàn)中一種常見的污染源。在操作過程中,如開蓋、吸樣等,都可能產(chǎn)生氣溶膠并導(dǎo)致污染。特別是在使用高濃度的PCR產(chǎn)物時(shí),氣溶膠污染的風(fēng)險(xiǎn)更高。

  4. 設(shè)備污染
         
    實(shí)驗(yàn)設(shè)備如移液器、離心機(jī)等在使用后未及時(shí)清潔和消毒,也可能成為污染源。

三、應(yīng)對策略

  1. 嚴(yán)格實(shí)驗(yàn)室管理
         
    實(shí)驗(yàn)室應(yīng)建立完善的管理制度和操作規(guī)程,確保實(shí)驗(yàn)環(huán)境的清潔和整潔。同時(shí),應(yīng)定期對實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行清潔和消毒,以減少污染物的存在。

  2. 規(guī)范實(shí)驗(yàn)操作
         
    操作人員應(yīng)嚴(yán)格遵守實(shí)驗(yàn)操作規(guī)程,避免不必要的污染。例如,在操作過程中應(yīng)使用帶濾芯的槍頭,避免陽性樣本污染槍頭;在打開反應(yīng)管前應(yīng)瞬時(shí)離心,以降低污染手套或加樣器的風(fēng)險(xiǎn)。

  3. 使用專用試劑和耗材
         
    試劑和耗材應(yīng)存放在專用的儲(chǔ)存柜中,避免與污染源接觸。同時(shí),應(yīng)使用高質(zhì)量的試劑和耗材,以減少污染的可能性。

  4. 加強(qiáng)實(shí)驗(yàn)監(jiān)測
         
    在實(shí)驗(yàn)過程中應(yīng)定期監(jiān)測污染情況,如使用特定的指示劑或標(biāo)記物來檢測污染物的存在。一旦發(fā)現(xiàn)污染跡象,應(yīng)立即停止實(shí)驗(yàn)并采取相應(yīng)的處理措施。

  5. 采用預(yù)防污染技術(shù)
         
    隨著科技的不斷進(jìn)步,一些先進(jìn)的防污染技術(shù)如UNG/UDG酶處理、氣溶膠過濾等已被廣泛應(yīng)用于PCR實(shí)驗(yàn)中。以德國MB公司生產(chǎn)的PCR Clean™為例,該產(chǎn)品是即用型噴霧產(chǎn)品,直接與污染物相作用,清除核酸污染。

 

PCR實(shí)驗(yàn)中的核酸污染是一個(gè)不容忽視的問題。為了獲得準(zhǔn)確可靠的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,我們必須高度警惕可能出現(xiàn)的污染跡象,并采取相應(yīng)的應(yīng)對措施。通過嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)室管理、規(guī)范的操作規(guī)程、高質(zhì)量的試劑和耗材以及先進(jìn)的防污染技術(shù),我們可以降低污染的風(fēng)險(xiǎn)并提高實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和可靠性。這將為后續(xù)的研究和分析提供有力的支持。

 


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